計算生命科学の基礎10(鬼頭 宏任)

>100 Views

March 05, 24

スライド概要

光合成では、その初期過程において、励起エネルギー移動反応や電子移動反応が生体環境下で巧みに制御され、最終的に非常に高いエネルギー変換効率が実現されている。この講義では、光合成蛋白質の構造情報や(定常/高速時間分解)分光実験情報をもとに、分子シミュレーションを用いて光合成初期反応素過程のメカニズムを理解するための理論研究手法について解説する。また関連する量子生命科学の研究についても紹介する。

シェア

またはPlayer版

埋め込む »CMSなどでJSが使えない場合

関連スライド

各ページのテキスト
1.
[beta]
0123456789

 

 

 !"#$%&

'()*+&,-./
0
1
2303456789:;<=>?@ABCD()&EFGHI9:#J

2.
[beta]
01

2345067

*+,-./
0123456789:;<1=>
9:?@AB/<CDEFGHDIJ
?KL123MNBOPQ1RS
TUVWXYZ?[\]Q^_
[`abBcKL\d]Qe

89 
 99 9!"#9$%&'!
""!'#&#()

3.

01 23456789 7  345674 ! "#$%&'(%)* +3,- !./ 01723456

4.

01234567 89 7  

5.
[beta]
0100234 5678 9 8

8

 !"#$

%&'()*+,-./012345678*+9:;<=>?*@AB

7.
[beta]
0123
45
6
7
8
9
       
%&'(

!"#$!
)*+

, -90./

+01
23456789:;<=>

8.

012345 6789 9 09       !"6#$%&'()8 *+,-./0123456

9.

012345 6789 9 2 9 9 68 9 9 9 9

10.
[beta]
0123456789 0

9



12 !"#$
%&'(3456783)*+,-./0121
234 !"#5678.9:;/0<3=>
8.?@AB5CD8.9:;
EFGHIJKLMNH3OPGQRKSTKUNOV 12W3 4X
YZ[85\-.1].9:;

%& 45678 +
,-.1ah+idjk_:l
456785^(_`1ab
456784cde91afg

  1  

m+nopqrsto+,:
uvw1x 4y5
z{?1a 3|}5~

11.
[beta]
01234561789

 7  !!"

!#"!$%&'


01234561(06)*+9,-.
/0123456789:9

12.

789 7  01234351622

13.
[beta]
012345678123459



12345 !"# $%0&'( )*+,

-./
012353)4566
7897:;<78977=
>?@ABBC

14.
[beta]
0123456789
 

LMN$OP
QRS

LMN$OP
QRS

789:;;ÿ=>?@?>;98A>B C8D>BEÿFGD>B

LMN$OP
QRS
F:BEHGEÿI@J9>K

!"#$%&'()*+,
-"./01234/56



0

15.

0 0123456789      !"#$ %5&' () *+,-. 0/012345

16.

ÿÿ !"#$  0      ÿÿ ÿ  0 0123456789

17.

0123456789 ÿÿ 89 89 ÿÿ  ÿ ÿ 0"#$7%5&' ("5)*+,  ! -./0123445

18.
[beta]
0123456789

45

8

16 !"#$
%!&1'()*+,,01-.23/01"
#$ 2345867
8 9:1;<=69:>"?@

19.

01203456789 #  !" !' $%&!. ()*+,- !2 /01  

20.

0123456789 012345 2  -./012345678 9&  !"#$ %&'()*+ ,"#$

21.

0123 4 56789 567 23 7  !"#$ %&'()*+ ,-./012345678

22.
[beta]
0123456789

5

 
UVWXQR
YZ[

ÿ !"#$$

HIJKLMNOPQRST

%&'()* +,-./01267893456789
:;<534567=>?0125@ABCBD8934567
+E8FG

23.
[beta]
01234 56789
 
Ö×ØÙÚÛ
ÜÝÞ

ÿ



¿ÀÁ¤¥ÂÃÄţƚ±Ç ÈÉÊ

ËÌÍÎÏ ÐÑÒÓÑÔÒÐÕÑ
!"##$%&'56789 ()*+,-./01 23456789:;<=>9?@<AB
)C;DEF G9HI.JKLM3*NO=>PQRA8STUVWXPYZJ[8H
\]9^_`aEFb<Acd*8e fghPiDjk%,-lm GCJK9QnbA
jk%9^Dopqrs9tuD[;vw8xyz{|9}~bb€E
7ZJ‚s2[ƒmH„CA †.‡ˆ‰3Š‹Œ8 T Ž9€‘’“ PA
8G9”•@<H–*–dAJKLM3*Q—[A˜™bb€E
wu“;š9›D|c œ™7AUVGC lmžbnŸ “;¡¢ £¤¥
€¦ £R“§P( (db€EC?A¨P“@<›d©A¡€_ª«
†STC š6.ALM3AHI QR7¬­;P®¯b,;A¥šF ? 9¥
›`b€°±C?iDEbnbA²?³@€¡¢ ¤¥=7w%&'56789 75´s
µsAX¶@<;D|[£,·Cb€E
c ¢¸P¹ºC¬»;b€56789 ()7¼½b;— ;PA¾@<;b€E

24.

01234567389  

25.
[beta]
9


'
!"#
$%
&
0123435162278
()*+(,*


6789:


-./012345

;<=>?@ABCDEFGHIJK

26.

  !" 01 2 3456789  9589

27.
[beta]
012345670896415793 47
 !"#$%&'()*+316951+5
,-./0123456789:;75;

OPQ79:;RS7TU597:;58ÿ S7TU:;7Qÿ456789:;75;
Q:WX87;Y

)<=>?@ABC

EFGIJ

D)EFGH

LKM

LKN

28.

01234567 '()*+,-./01234 89  ÿ ÿ  ÿ! " ÿ"#ÿ$ÿ% &

29.
[beta]
01123456789

67
ÿÿ !"#$%&'

()*#+

,-.//0ÿ234567ÿ89:7;<9=

)*#+

,-.//0ÿ234567ÿ89:7;<9=

30.
[beta]
0123456789

ÿ!"!#ÿ$%&'ÿ(#)ÿ*+,ÿ*+,ÿ
-./01212ÿ.45ÿ67ÿ9:;<7ÿ=:>?7ÿ@AÿBAÿCDEFGÿHEIIFJ5ÿ


56yÿz{,|}~€‚ƒ„ †
‡ˆ‰ŠF‹ŒCH/J

KLMNOPQRSTUVWSXYZ[
KL\NOPQRSTU]^_`abcdefd
ghiVjkl_mnoSPQRpVqr
KLsNOPQRptuabcdvw^xVZ[

56yŽÿ{,z,|}~‘’“€
‡ˆ‰ŠF‹ŒCH/J

31.
[beta]
0123456789

 !"#$%&
'()*+,-./01234!5678



PQRÿTUVWWUXYZ[\]T

^_G>ED@`ÿaBObBIcdefghijÿljmÿnomÿpqqrKÿspttuvKÿ
†‡ˆ‰Š‹Œ3Ž‘’“”,•–—˜™.š›

9::;<;=>ÿ@;ABCÿDAAECFF@GHBIBJ=K<GLFLM>A;N:O

wxyz{ |} {~€y‚ƒ„ €z
«T¬]­®¯°T±V²³´µ¶·¸¹
º»

œ79žŸ3 ¡¢£¤¥¦§¨ ©ª

'()*+,-¿À3ÁÂÃÄÅÆÇÈ5ÉÊË¿Ì
ÍÎÏÐÑÒ/ÓÔÕÁÂÃÄÅÆÇÈ5ÉÊËÖ
×،3ÏيÚÛÆ$Œ3Ü

¼½D>¾=
½D>¾=

32.
[beta]
0123456789 9
 !"#$%&

8 

'()*+,
-./0

'()6+,
./0

:* ;<

:* ;<

:6 ;<

=>12
?@12

:6 ;<

12348
5(6179
89

?@12
=>12

33.

01234567 89 2 !7 "#$%%&2'()

34.
[beta]
0123456789

1 234012

ÿ"ÿ#$%

 

51 234 67ÿ89:;

OPÿVWWR
OPÿVWRR

OPÿRSTU
<=>?@ABCDECF>?@GCDHIJKLMN

&'(&)*ÿ,-./*(0-

35.
[beta]
345ÿ95 27ÿ5256
XYÿ[\]^_`abcdef

klmnopqrsltnqmsuvlwfÿyz

KLMNOPQR STUVW
 !
EFGHIIJ "#$%&' )*+,-./0 {n}tnlmƒÿzÿlsÿqm„ÿŠ‹j[^‹[HIJŒ
4*+,-.-.

€ÿot
‚q|ƒz„ÿlsÿqm„ÿ`abi[†‡‡ˆ

‘wtqu

gYÿh`ij^`def

1233,-.//{tll|ÿ}~m~tÿpqrsltnqÿsuvlwfÿyz
"#$%&((
56:;789*+:;<=;=<>
/ ?>?9@A<B;>CD
0ÿ23456ÿ78ÿ95 27ÿ
5256ÿ96

kqqŽ~r‰nƒÿÿlsÿqm„ÿ`aYÿ]hhb^YHIHJ

rtuow’“

‘wtqu

z‰l|ƒ„ÿlsÿqm„ÿŠ‹j[^‹[HIHI

rtuow’“

36.
[beta]
01ÿ3456789 

61ÿ78.68 
"#$%#&'(ÿ)

ÿ
ÿÿÿ893

!

"893%5#ÿ:ÿÿÿ891ÿ-577 61/0/1
*#+#ÿÿÿÿ,-.36-3/012
*ÿ+343ÿ$%#ÿ&'(ÿ)

5ÿÿÿ,-.36-3/0/0

37.
[beta]
!"#$%&'(!)#&

bdef

stŸ ¡¢£¤ ¥¦§¨©
ŒŽ‡ˆ‰‰Š

0123456789
„ †‡ˆ‰Š‹

^_`ab
†‡ˆ‰ˆ‰

 48331
*32179448+81
, -./ÿ123451267689:27ÿ;<=ŒŽŽ‡ˆ‰ŠŠ
21ÿ>?@16A37BC
DEF92ÿHÿIJKL"ÿ&N
O!'$PQ$R!Rÿ
^_`acc
S#(LTUÿVWXYZ[\]
v”•‘’“ †”•–—•—–˜
Š ™˜™“š›–œ•˜ž
opqÿsthiÿ
?161g<679./hiÿj4A7klmÿ {|}
9<@
n4667=9<@
~€q~_ unj44667=
A7kvmÿÿÿwxl
af‚ƒ
j4A7kllmÿÿwxll5Ay9A37ÿ8zÿ8./

38.
[beta]
   !
"#$%&'()"*+,- ./0%12$"*,
345 6"#$7($"* 89:;<=>
3?5 6./0@ABA89:CD9E

3?FGHAIJKJLMN A:@AB OPLQ

012ÿ4567

8596ÿ4567

|}~}€‚ÿ„}€†€ÿ‡ˆ‰Š‹ŒÿŽ‘
RRSTUVWX
YZ[\]^_`aSbc

Sde fgh

ijk\lmnoVpqr
]YZ[stuvwc
\xy ijk\
z{xa

39.

0123314567890 890  !"#$ %& '()(*'    

40.
[beta]
0 

 

1234561,-./0*



0123456789

789:;<=>?@;

**ÿ,-./0*

4567 ! "#$%&'()

41.
[beta]
0123456789 0

 

!"#$%&!



'()*+,(-./01

ÿ 

'()*+,(-234567 894:;+(<=>?@A

42.
[beta]
0123456789



"6$%&)*+,9789
:; <$=+>%$?@A

$%&)*+,

$%&'($%&)*+,-.
/01ÿ#2ÿ345

ÿ"
#ÿÿ$%&

"

43.
[beta]
'()*+,-.

/

1
2
;
F3
4
G
H5
6
I
7
J
K
9
5
:
A
L;
<
=
>
?
@
A
7
B

CDE

3
!"#$%&

88

0

0123456789

20 20ÿ012

44.
[beta]
)*+,-./0

'(1

3
4
=
5
F6
G
7
H
8
I
9
J
K;
7
<
C
=
L>
?
@
A
B
C
9
D

1E0




::

'(2

 !"#$%&'(

012345 60123789ÿ

45.
[beta]



012ÿ4567
8596ÿ4567


 !"#$%&'()*+%&
$,-./01)-23$
%4567

8 9:;<=> ?@ABC
%DEF

46.
[beta]


789



0123456

 ÿ
"#$ÿ





'()*+

%&

,-.+/01(23456789&:;<=

>?@ABCD

EEFGHIJKLMNOPQ
2RSOTQ+



/01(;


47.
[beta]
7 89



 !"

0123456

 

pVZqV-rÿ+,-a_Usÿtuÿwxyzuÿ{x|}uÿ~~sÿ€€€ÿ‚ƒ„„ƒ

#$%&'()*
no%&'()*

+,-./0123456789:;
<=>?@ABC5DEFGHIJKLMLNOPQRS

bcdefcgdhiCjFklm:

T/UVWXYZU[VYZÿ
]YU[-Y^_[Y/Zÿ̀_Za[Y/Z

48.
[beta]
STUVWXYZ[\2

01234567689ÿ 98
01234567ÿ9:;<:=>?@ABCDEÿGEHÿIJHÿKLLMNÿOKPPQRNÿ
 !" ##$%&!'(&)ÿ+"',-./

]^_]`abc^defghijklmnopqlrrstuvwx

49.
[beta]
 !"#2

0123456789 ÿ ÿ9ÿ551
$%&'()*+,ÿ.'/ÿ012345ÿ6785ÿ7776ÿ98:6:;/

>
@
<
G
F
<=> ?ABCCD D HI> JIK>LHGEKMNL
E
E F F
K
>L
>
>
<GF ?GF @O@JGF KPOPL

<GF> QRSTUVWXYZ[\]^_Z`abcd
ef]ghijkglmjkVnopqrdstuv
GEMN QRwxyz{|}V~€V‚ZƒYqr

„ †V‡qˆ‰Š‹ŒŽ‘’d“”
]^u•–—˜™ŠYšuv

50.
[beta]
0123456789



Pÿ/Q(+%R%S$ÿ"%(ÿ
ÿ!"#$ÿ%ÿ&'#ÿ!(ÿ 
)ÿT+$ÿÿ%#ÿQÿ,ÿ%ÿ
)ÿ*+$ÿ%ÿ!"%(ÿ 
'+ÿ(U%ÿ0#
,ÿ-%($ÿ."%%ÿ/((((0%
V2ÿW64<Xÿ;<ÿ6=2ÿYÿ>Z[\]^_ÿZÿ̀ABZaZbBFGcDa\Cÿ^]dÿ

1234567849ÿ;<ÿ6=2ÿ>?ÿABCD?ÿEBFG?ÿHÿIJKL9ÿM9ÿKJNJO2

ABZaZecZ_ZfCÿghÿEBFGcDa\CÿijMkIJKlmÿLIInLoK

iÿ&(ÿ+)%Sÿ)ÿ+($%ÿ
+S0%(pÿ0+%(ÿ)ÿ##ÿ(+ÿ"%%S
W4qX84r6=sÿt6u<6v479ÿÿABCD?ÿEBFG?ÿEBFG?ÿABCD29ÿIJIK9ÿPi9ÿILOww
-Rx*yz{R|}#)PR~|

51.
[beta]
0123456789

2


CDEFÿHIJHIKHLMNOJPNQNJRSIITHR
UJÿVWXYJÿZWX[\]ÿV[Y^_Q̀ÿbcdefÿdbfÿgdbhigdjk

!"#"$ÿ&'(((ÿ)*#+, -.#/*"#-ÿ) *"ÿ)0"-#!ÿ
1+),))23456789:;<=>?@AB89

52.
[beta]
012345678

QRSTUVWXYZ[\]^_`

QRaTUbcdefghdij

1234256ÿ895:;<=>ÿ@ABC>ÿDAEF>GÿHHIGÿ
JJJKLÿMNOONPLÿ
9

 !"#$
%&'()*+,-./0

|}~€‚~ƒ„ „†‡„ˆ‰Š‹ŒŽ
}‘’“”•|’“–—˜™
š-›.œ‚$žŸ‚‡ ¡¢
k22Gÿl;mGÿ6ÿnmo25Gÿp33;Lÿ12qLÿrst<Lÿns2uLÿNOvwLÿwKxwyJzw{

53.

01234567 89 2 !7 "#$%%&2'()

54.
[beta]
0123
“
“

“

j8< g7 m”•–”m—< < A7B ” š
7‘’

7‘’
B˜™
7

›œžžŸž¡¢£g7 8g¤ —fg7
›œžžŸž¡¢¥¦œ§£fg7
¨©ªœ«Ÿœªª«¬­®œŸ¡£A7B
7
g¤ ˆ†ƒÿ̄°±Œÿ²€³´¯‡‚ÿ€ÿ¯µÿ°ÿ€‡ÿ‚Œ¯ÿ¶°± ´

456789 76ÿ69 7ÿ7ÿ
  !""#$%&'(ÿ*+,- ./01
2345267 5 89:;< =>=7 ? 59@=7
CDEFGHC 8IJ567 5KL 5MN=67 @=B OPL
A7B

z{|}ÿ€‚ƒ€„‚€†‡ÿ†ˆÿ‰ƒzŠ‹ÿ€‡ÿŒŽ

b78cÿc cdeÿ7ÿ

uvu3wxy

7
h
f>
=
fg7 8ijkk< < mn7 9no7pm>loqrp
l = =
l
o
7p
7
7
f>= 8>= hsh9>= otstp

·f>=7 ¸¹ÿ̄¶°º°‚¯µÿ„»ÿ‚Œ¯ÿzŠ‹ÿˆ€‚‚€‡³ÿ±Œ¯´¯ÿˆƒ†´ÿ
‚Œ¯oqÿ¼rp
‰½}Ž¾¿½ÀÁÂËÿ±°º±º°‚€†‡|
·>l ¸†ˆÿ‚Œ¯ÿ°²†½²ƒ†‚¯€‡ÿ²°ƒ‚ÿ°‡µÿÄ°‚¯ƒÿ́†º̄±º̄ÿ
įƒ¯ÿ¯‚ÿ‚†ÿ‚Œ†¯ÿ†ˆÿ¾¿ÀzÿˆˆÅƊÀÿ°‡µÿ‰Ç‹Á‹|ÿ



UVWXYÿ[\]V^_`ÿ
>=a

KRQST

ÈÉÊÿÌÍÎÏÐÑÒÿÓÔÿÕÏÖÿ×ØÙÚÛÜÿÉÝÞÜÿÝÝÝÉÿßÞàÉàáÖ
ÈÞÊÿâÒãÿÓÔÿÕÏÖÿ×äÙÙÜÿÉÉÞÜÿÉÞàåÿÿßÞààæáÖÿ

55.
[beta]


%&'()*+
ÿ ÿBCD3
01456789

01456789
,08"860-

 0!"ÿ#!8!
1 72

1
7
3
ÿÿBCD3.4567/
$
01 3 01 2 012 013
01
01
$
$$
13
0!8 !0"ÿ0 1806!"08
72 34567859:;<76=>ÿ@6A69@ 12

56.
[beta]
012345678 9

   !" #$!%&'
()*+,+-./+--*01+23.454.06),0757.8.4.+-

(./+ÿ0:ÿ;+80358./+;ÿ-54+



<=>?@ABCDE>?@AB

mnop^qr
45678FGHIJKLM
NOPQ23R3ST'
UVWXYZW[X\]^_M`ab
cde fg^%hij%kl

57.
[beta]
01232456789 6

!" 
 #$



„ .%&()*†‡ˆ>*‰ŠG
N 1OPQRK1STUV
HH>IJKGLMJ
WXYZDE[\

%&'()*+,-./01
2345637489:;<=>?0@
A:?BCDEF

]^_`

 G

abcdeÿghhicjdkblÿmnbckodÿpagmq*rs
}~J €M €
tuvwxy {z |IMKIKJ
‚ƒ()

Mz

58.

 3562  !ÿ626577     23 56789 00123ÿ56789    5898ÿ8289ÿ2 

59.

 00123 45678ÿ7 23 45678ÿ7

60.
[beta]
0123456789



 !ÿ!#!$%&'()(*#+!,$-./011

2344556789
2:;<=>;<012?34567@A=BCD1E?FGHI
2JJ<=KJ<012?L57@32

61.
[beta]
 !"#$$%&'()*+

012 3456ÿ6869 4569

,-./012345678
,9:;<:=;>?@-

62.
[beta]


0 1234256789
766274426787
664766787 6528
0 342284256789425627442678
4256274426787
55675819218568112 9 7662:452
;<67<8121868 -942562:452

!""#$%&'!()#&*##(+, 83 -

./0

112

+,

63.
[beta]
01

23456789

9 !"#"$

+, '-./0 1234
56789*:;<
=>?@ABCDE*F
GH#I.JK#LM
NE*F



%&'56()*

64.

 !"#$%&'()*+,-. 0123ÿ25ÿ6789ÿ  9ÿ26ÿ

65.
[beta]
34567895:;<=>?@ABCDEFGBHIJKLMNO

01234567ÿ9 ÿÿ7ÿÿÿ
ÿÿ!"#$ÿ&'(')&'&*

01234567ÿ9 ÿÿ7ÿÿÿ
ÿÿ!"+$ÿ,--.),-(/
01234567ÿ9 ÿÿ7ÿÿÿ
ÿÿ!"#$ÿ&'(')&'&*

01234567ÿ9 ÿÿ7ÿ01 2

66.

0123456789 

67.
[beta]
0123456789

 

 !"#$%&'()*+,-./012345678989:;<898=:;>

$%&'?@ABCDEFG&'HFAIJ

KLMNOPQRS TU VW XY89WZ23KL[\]^_`abQ89WZ7c31d 89WZ23KLea

fghÿjklmnopqrstuvwuxyz{ |o}}qn~€€€‚n}mƒ„qnp}‚†klq‡

68.
[beta]
0123456789



 !"#$%&'()*+,-./01234567
89:;.<= >?@2ABCD,-;/=EFGHIJKL;MGNOP
O1QR SBQTCJ

69.
[beta]


 !"#$%&"#'()*+,"-.
/012

34564789
:;<=>?@ABC7DE46F1E71GHI
JKLMNOPQRSTUVWABXY
Z[\Q]^_5`45647
hijknopqrs
hijkm
hijkl

abcdf

01234ÿ36ÿ748ÿ9 

hijkt

abcde
abcdg

70.
[beta]
 !"#$%
01)*/2/
!&'()*+,-.&*/"#$%
0123$3#456789:;

0123
9
8
 0123
0123


0123
0123
0123
4
01234

0123
6
0123
6
0123
7
 0123
0123
55

71.
[beta]
 !"#$%&'()
*+,-./0123456
78)9:;:<=>?@ABC"DEFGH IJK
LM78N45OPQÿLM78N45OP

01ÿ3456789 




72.
[beta]
0123456789



ÿ !

89
HC;I>?@ÿBCDEFG@
:;<=>?@ÿBCDEFG@
"#$%&'3()5$
*+,-./01234567

JKLMÿNKLOPQRS!

73.

012345670896 9 2 012862 

74.

    0123456789   67 

75.
[beta]
0123456789



3 !"#$%&'()*&+,*-./0,123 4
56*789:;<=>?@%ABCD>?@
5EFGHIJKLMNOP89:;QR*ST,UV
5WXYZ4[G 8\]^=_?`aGH\bABCD>?@
GH,cdef123g
5P=M?A?PhijLkl46*7mnopq 8rs\b
tg%cd9u,vwVxy4
ABCD>?@z{g|}7~ m&3€m‚/0UV
ƒ(„ ,†‡Vz 4

ˆ‰ˆŠ #$‹,Œ,}7UVz z4
ŽR3‘%ˆ‰ˆŠ ’“”bI z4
‰U•,123g 2&–%‚/0—˜™š4›œ Už&
!"Ÿ  ¡¢U z4

76.
[beta]
0123456789

3789
789
 !
"#789
LMNO PQRSTUVWXYZ[\(U]'%^

$%&'()*+(,-./012345627
892:;<=>?@AB2CDEFGHI0J61K