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title: NDBデータの利用経験: サンプリングデータセットを中心に
tags: 
author: [奥村 泰之](https://www.docswell.com/user/icer)
site: [Docswell](https://www.docswell.com/)
thumbnail: https://bcdn.docswell.com/page/4EQ5W3MNJP.jpg?width=480
description: NDBデータの利用経験: サンプリングデータセットを中心に by 奥村 泰之
published: September 14, 24
canonical: https://www.docswell.com/s/icer/KR22JR-2024-09-14-102007
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# Page. 1

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/4EQ5W3MNJP.jpg)

NDBデータの利用経験: サンプリング
データセットを中心に
奥村泰之
一般社団法人臨床疫学研究推進機構 代表理事
第7回NDBユーザー会 2023/9/14 (土) 15:15~17:15
東京大学
NDBの様々な提供形式における経験談


# Page. 2

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/KJ49K1V371.jpg)

目次
◼サンプリングデータセットの概要
◼初回申出の苦労
◼普及に向けた試み
2


# Page. 3

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/LE1KXG3ZJG.jpg)

略歴
専門
臨床疫学
非薬物療法の臨床試験
大規模医療データベースを活用した臨床疫学研究
最終学歴
2009年 日本大学大学院 博士 (心理学)
職歴
国立保健医療科学院，日本医科大学，国立精神・神経医療研究セン
ター，医療経済研究機構，東京都医学研究所を経て現職
現職
一般社団法人臨床疫学研究推進機構 代表理事
受賞歴
PCN Reviewer Awards 2021, 2022, 2023
2019年 日本疫学会奨励賞
第4回「藤田賞」精神保健統計分野
第11回「臨床精神薬理」誌賞 最優秀論文賞
第9回「臨床精神薬理」誌賞 優秀論文賞
NDB利用実績
査読付き論文12編
3


# Page. 4

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/GEWDNKP6J2.jpg)

NDB・介護DBの申出経験数(新規申出ベース)
4


# Page. 5

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/47ZG3ZKRE3.jpg)

NDB特別抽出のハードル
◼煩雑な申出手続き
◼膨大な初期費用
◼柔軟性を欠く手数料
◼膨大なデータ提供までの時間
◼膨大な技能習得の階段
◼利用規定違反に伴うリスク
5


# Page. 6

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/YJ6YXZQ17V.jpg)

NDB+介護DB連結解析のハードル
◼申出負荷はNDB単独の倍以上
◼情報公開の不足 (要介護認定情報が歯抜けに
なってることは重大)
◼ノウハウの共有不足
◼ID4の怪しさ
◼ID5の難解さ
◼公表物確認の待機期間
6


# Page. 7

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/GJ5GXWRLJ4.jpg)

入門はサンプリングデータセットを推奨
NDBの利用を検討している方へのマニュアル
(https://www.mhlw.go.jp/content/12400000/001074007.pdf)
7


# Page. 8

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/LE3RX4PD75.jpg)

層別抽出法による代表性のある単月デー
タセット
NDBの利用を検討している方へのマニュアル
(https://www.mhlw.go.jp/content/12400000/001074007.pdf)
8


# Page. 9

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/8EDY2QL2EG.jpg)

層別抽出法は標本抽出理論により代表性
が担保される
レセプト種別 (医科入院/医科入院外/DPC/調剤)
×
性別 (男女)
×
年齢 (0~9各歳，10~100歳[5歳ごと]，100歳以上)
WallStreetMojo (https://www.wallstreetmojo.com/stratified-sampling/)
10%抽出
OR
1%抽出
9


# Page. 10

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/V7P61L2LJ8.jpg)

特別抽出 vs サンプリングデータセットの
ハードルの比較
特徴
特別抽出
サンプリングデータセット
審査の厳しさ
厳しい場合もある
易しい
セキュリティルームの整備
必要
不要
倫理審査の承認注
必要
不要
データ入手までの期間
承認後1年ほど
承認後すぐ
情報機器等の費用
200~300万円
30~100万円
データ抽出手数料
50~150万円
30~50万円
データハンドリングのハードル
困難
少し難しい
公表制限
あり
なし
注. NDBの規定上という意味であり，倫理審査委員会の内部規程に依存する。
10


# Page. 11

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/2JV3YQD6EQ.jpg)

特別抽出 vs サンプリングデータセットの
データ構造の比較
特徴
特別抽出
サンプリングデータセット
点数表区分
医科・DPC・調剤・歯科
医科・DPC・調剤
診療月
通年
単月
患者の追跡性
○
✕
公費単独
○
✕
匿名医療機関コード
○
✕
都道府県コード
○
✕
高額レセプト・出現
頻度の低いコード
○
✕
介護DB等との連結
○
✕
11


# Page. 12

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/5EG39WY27L.jpg)

サンプリングデータセットの提供期間
直近の経験では待機期間は約6か月
その他は約3か月
提供申出者
国立精神・神経医療 医療経済研究機構 臨床疫学研究推進機構
研究センター
申出日
2012年5月14日
2017年6月30日
2021年10月8日
(変更: 2024年4月26日)
承諾通知日
2012年7月12日
2017年9月8日
2022年1月12日
(変更: 2024年7月8日)
手数料決定日
NA
NA
2022年7月13日
(変更: 2024年7月25日)
データ提供日
2012年10月20日
2017年11月20日
2022年7月25日
(変更: 未定)
手数料
NA
NA
375,797円
(変更: 442,246円)
12


# Page. 13

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/4JQ5W3M97P.jpg)

研究テーマの設定例
◼診療の質の評価
◼急性疾患の発症率の推計
◼薬剤の年間処方量の推計
◼診療報酬改定前後の診療の質の変化
13


# Page. 14

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/K749K14RE1.jpg)

研究成果一覧①
主著者
奥村泰之
關真美
飯原なおみ
木村通男
荒川亮介
Naomi Iihara
佐藤悠子
Hiromi
Hagiwara
標題
雑誌名
IF
日本全国の統合失調症患者への抗精神病薬の処方パターン: ナ 臨床精神薬理 NA
ショナルデータベースの活用
サンプリングデータセットを用いた併用禁止医薬品等の処方実 医療情報学
NA
態研究
わが国のナショナルレセプトデータベースが示した運転等禁
医療薬学
NA
止・注意医薬品の使用実態
レセプト情報データベースを用いた調査: 紹介時同月内異施設同 医療情報学
NA
一検査実施状況
ナショナルデータベースを用いた外来診療における抗不安薬・ 臨床精神医学 NA
睡眠薬の処方実態の検討
Polypharmacy of medications and fall-related fractures in older J Clin Pharm 2.51
people in Japan: a comparison between driving-prohibited and Ther
driving-cautioned medications [日本の高齢者における薬物療法
と転倒骨折のポリファーマシー：運転禁止薬と運転注意薬の比
較]
ナショナルデータベースを用いた，がん患者の死亡２週間前の Palliat Care Res NA
終末期医療の質の評価: サンプリングデータセットの活用とその
限界
The survey of the compliance situation to the antihypertensive Yakugaku
therapy guideline by analyzing Japanese National Claims Data [ Zasshi
ナショナルデータベースの分析による降圧療法ガイドラインの
遵守状況の調査]
NDBを活用した査読付き論文リスト (https://icer.tokyo/materials/ndb_references/)
0.30
14


# Page. 15

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/LJ1KXG4V7G.jpg)

研究成果一覧②
主著者
Mai Sato
標題
雑誌名
IF
Nationwide survey of severe postpartum hemorrhage in Japan: J Matern Fetal 2.40
an exploratory study using the national database of health
Neonatal Med
日本における分娩後異常出血の全国調査：全国
insurance claims [
健康保険請求データベースを用いた探索的研究]
Hidetoshi Igari A retrospective observational study of antimicrobial treatment
J Infect
for non-tuberculous mycobacteria disease using a nationwide
Chemother
全国の保険金請求データベースを用い
claims database in Japan [
た非結核性マイコバクテリア疾患に対する抗菌薬治療のレトロ
スペクティブ観察研究]
2.21
Hidetoshi Igari Epidemiology and treatment outcome of pneumonia: analysis
J Infect
based on Japan national database [肺炎の疫学と治療アウトカム: Chemother
日本のナショナルデータベースに基づく分析]
2.21
Hidetoshi Igari A retrospective observational study of antibiotics treatment for J Infect
sepsis using a nationwide claim database in Japan [ 日本における Chemother
敗血症に対する抗菌薬処方のナショナルレセプトデータベース
を用いた後ろ向き観察研究]
2.21
Ai Kido
2.69
Nationwide incidence of central retinal artery occlusion in Japan: BMJ Open
an exploratory descriptive study using the National Database of
Health Insurance Claims (2011-2015) [日本における網膜中心動脈
閉塞症の全国発生率：全国健康保険請求データベース（2011～
2015年）を用いた探索的記述的研究]
NDBを活用した査読付き論文リスト (https://icer.tokyo/materials/ndb_references/)
15


# Page. 16

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/GJWDNKX372.jpg)

研究成果一覧③
主著者
Yamazaki
Shingo
標題
雑誌名
Antibiotics prescriptions for pneumonia analyzed by claim
Int J Clin
information in Japan [日本のレセプト情報の分析による肺炎に対 Pharmacol
する抗菌薬処方]
Ther
IF
0.98
Taisuke Yatomi Prescription patterns of psychotropics in patients receiving
Acta Psychiatr 6.39
synthetic glucocorticoids [ 合成グルココルチコイド投与中の患者 Scand
における向精神薬の処方パターン]
Atsushi Mizuno Differences in aggressive treatments during the actively dying
Heart Vessels 1.81
phase in patients with cancer and heart disease: An exploratory
study using the sampling dataset the National Database of
Health Insurance Claims [がんと心疾患患者の終末期における積
極的治療の差: NDBサンプリングデータセットを用いた探索的研
究]
Misuzu Yahaba Antibiotics for hospitalized children with community-acquired
J Infect
2.21
pneumonia in Japan: Analysis based on Japanese national
Chemother
database [日本における市中肺炎により入院した子供への抗菌薬
処方]
竹下康平
NDBサンプリングデータセットを利用した急性期脳梗塞の入院 脳卒中
期間に関連する因子の研究
NDBを活用した査読付き論文リスト (https://icer.tokyo/materials/ndb_references/)
NA
16


# Page. 17

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/4EZG3Z6GJ3.jpg)

研究成果一覧④
主著者
標題
雑誌名
IF
Shin Kuramochi Drug combinations for mood disorders and physical comorbidities that Pharmacopsychi 2.54
need attention: A cross-sectional national database survey [気分障害 atry
と身体疾患における注意が必要な併用療法: 全国データベースに
よる横断的調査]
Tami Sengoku
下川 尚子
Noriko Tsuji
Prevalence of type 2 diabetes by age, sex and geographical area
J Epidemiol
among two million public assistance recipients in Japan: A crossCommunity
sectional study using a nationally representative claims database [日 Health
本の生活保護受給者200万人における2型糖尿病の年齢・性・地
域別有病率: 全国代表的レセプトデータベースを用いた横断的研
究]
National Databaseオープンデータおよび外来サンプリングデータ 脳と発達
解析で明らかにする本邦の小児鎮静MRI検査の実態
6.29
Trend of anticoagulant therapy in elderly patients with atrial
Sci Rep
fibrillation considering risks of cerebral infarction and bleeding [高齢
の心房細動患者における脳梗塞および出血のリスクを考慮した
抗凝固療法の変化]
5.00
NDBを活用した査読付き論文リスト (https://icer.tokyo/materials/ndb_references/)
NA
17


# Page. 18

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/Y76YXZ2QEV.jpg)

NDBサンプリングデータセット
の利用経験: 初回申出の苦労
18


# Page. 19

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/G75GXW2274.jpg)

初めてのNDB
向精神薬の処方パタンの探索的分析
匿名医療保険等関連情報の第三者提供の現状について （報告）
(https://www.mhlw.go.jp/content/12400000/001262623.pdf)
19


# Page. 20

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/9J2YXQ41JR.jpg)

研究に至る経緯
学位取得
2009
2010
2011
2012
DPCデータを活用した
研究開始
特別抽出利用申出
サンプリングデータ
セット利用申出
20


# Page. 21

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/DEYG8WM4EM.jpg)

タイムライン
201204
利用申出
08
データ受領
12
201304
論文投稿
論文受理
08
21


# Page. 22

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/VJNGQ9W678.jpg)

利用申出の目的
◼ナショナルデータベースを活用し
て，向精神薬の処方パタンを探索的
に検討することを目的とする。
22


# Page. 23

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/YE9WD2XRE3.jpg)

運用フロー図
23


# Page. 24

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/GE8N352G7D.jpg)

個室整備
24


# Page. 25

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/LELPVY2X7R.jpg)

端末
◼モデル
◆DELL Precision T7500
◼CPU (6コア)
◆Intel® Xeon® Processor E5645
◼メモリ
◆24GB
◼OS
◆Windows 7 Professional
25


# Page. 26

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/4JM4GN837W.jpg)

記録媒体
◼BUFFALO RAID1対応 USB3.0用 外付け
ハードディスク 2ドライブモデル 4TB
HD-WL4TU3/R1J
26


# Page. 27

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/PJRWZD5R79.jpg)

ソフトウェアとパッケージ
◼ソフトウェア
◆データ解析環境R x64 2.15
◼パッケージ
◆XLConnect
◆snowfall
27


# Page. 28

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/PEXP91KY7X.jpg)

データベースの構造把握
サンプリングデータセットの使用経験
(https://www.mhlw.go.jp/stf/shingi/2r9852000002ss9z-att/2r9852000002sse8.pdf)
28


# Page. 29

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/3EKDP254JD.jpg)

データの確認
29


# Page. 30

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/L73RX4KDJ5.jpg)

ファイルの確認
30


# Page. 31

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/87DY2Q327G.jpg)

データレイアウトシートの作成
列番号
ソフトウェア上の
変数名
利用する変数
変数の意味
データの型
コードの意味
31


# Page. 32

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/VJP61L4LE8.jpg)

ファイル一覧表の作成
ファイル名 レコード種別
行列サイズ 利用項目
1_IR.csv
医療機関情報レコード 130801*12 なし
1_RE.csv
レセプト共通レコード 130801*38 氏名、男女区分、生年月日、病棟区分
1_HO.csv
保険者レコード
1_KO.csv
公費レコード
1_SY.csv
傷病名レコード
1_SI.csv
診療行為レコード
1_IY.csv
医薬品レコード
1_TO.csv
特定機材レコード
1_CO.csv
コメントレコード
251795*50 なし
1564295*7 なし
1_NI.csv
日計表レコード
33337*34
なし
1_SJ.csv
症状詳記レコード
128618*5
なし
130801*17 診療実日数、合計点数
22352*14 診療実日数、合計点数
1484571*10 傷病名コード、診療開始日、主傷病
診療行為コード、数量データ、点数、
4980164*46 回数
1961452*46 医薬品コード、使用量、点数、回数
32


# Page. 33

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/2EV3YQX67Q.jpg)

統合REテーブルの作成
◼入院-外来-DPC-調剤の統合
区分
ID
1
男女区分
年齢区分
2
7
2
3
2
1
7
1
4
5
1
2
11
11
DPC
DPC
6
7
8
2
1
1
14
15
14
DPC
調剤
9
10
1
1
13
4
調剤
調剤
11
12
1
1
2
13
医科入院
医科入院
医科入院
医科外来
医科外来
医科外来
33


# Page. 34

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/57G39WV2JL.jpg)

統合SY-SBテーブルの作成
◼入院-外来-DPCの統合
区分
ID
傷病名コード 主傷病
医科入院
1
2809009
医科入院
1
8841290
医科入院
1
8840042
医科外来
2
8833421
医科外来
2
医科外来
3
8841393
DPC
4
8838585
DPC
4
6441002
DPC
4
6563004
01
01
01
34


# Page. 35

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/4EQ5W369JP.jpg)

統合IY/SI-CDテーブルの作成
◼入院-外来-DPC-[調剤]の統合
区分
ID
医薬品コード 回数
使用量
医科入院
1
620491801
7
1
医科入院
1
620491801
2
0.5
医科入院
1
643310473
2
医科外来
2
610421335
2
医科外来
2
620004575
2
医科外来
2
620459001
56
1.34
DPC
3
620004798
1
5
DPC
3
661310146
1
5
調剤
4
620452801
3
14
調剤
4
613130595
3
14
35


# Page. 36

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/KJ49K1MR71.jpg)

データ全体の記述
患者背景
変数
レセプト区分
医科外来
医科入院
DPC
性別
男性
女性
年齢
0-9歳
10-19歳
20-29歳
30-39歳
40-49歳
50-59歳
60-69歳
70-79歳
&gt;= 80歳
N = 979,756
人数
%
755,247
130,801
93,708
77.1
13.4
9.6
431,386
548,370
44.0
56.0
88,131
44,582
48,055
73,437
78,215
100,586
174,523
203,970
168,257
9.0
4.6
4.9
7.5
8.0
10.3
17.8
20.8
17.2
36


# Page. 37

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/LE1KXG8VJG.jpg)

データ全体の記述
精神科関連病名
変数
1. いずれかの精神疾患
2. うつ病性障害
3. 双極性障害
4. 統合失調症
5. アルコール使用障害
6. 物質使用障害
7. 不安障害
8. 摂食障害
9. 広汎性発達障害
10. 行為障害
11. 知的障害
12. その他
主傷病
人数
%
52,575
13,228
3,024
22,119
1,467
64
4,910
496
900
217
845
7,469
主傷病/副傷病
人数
%
5.4
1.4
0.3
2.3
0.2
0.0
0.5
0.1
0.1
0.0
0.1
0.8
145,719
47,407
8,341
42,576
2,626
208
36,269
4,950
1,891
614
2,275
45,030
14.9
4.8
0.9
4.3
0.3
0.0
3.7
0.5
0.2
0.1
0.2
4.6
N = 979,756
37


# Page. 38

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/GEWDNKZ3J2.jpg)

同僚との相談
統合失調症が結構多いから「抗精神病薬の多
剤処方の記述」はテーマとして面白いかも
38


# Page. 39

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/47ZG3Z1GE3.jpg)

同僚との相談
✓ 精神病床入院は薬剤料の包括があるので注意
✓ 精神科外来は通院・在宅精神療法を取るもの
✓ 主傷病で蓋然性が高まるかも
✓ 抗精神病薬の無処方は想定し難い
39


# Page. 40

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/YJ6YXZLQ7V.jpg)

包括病棟と出来高病棟の記述
全患者
(N = 979,756)
・外来 (n = 755,247)
入院
(n = 224,509)
・精神科以外 (n = 198,232)
精神科包括病棟
(n = 12,805)
精神科出来高病棟
(n = 13,472)
・統合失調症なし (n = 6,020)
・統合失調症なし (n = 5,650)
統合失調症 (主傷病)
(n = 6,785)
統合失調症 (主傷病)
(n = 7,822)
・非定型抗精神病薬加算なし
(n = 2,374)
・定型抗精神病薬のみ (n = 1,026)
・抗精神病薬なし (n = 431)
非定型抗精神病薬加算
(n = 4,411)
非定型抗精神病薬あり
(n = 6,365)
40


# Page. 41

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/GJ5GXW12J4.jpg)

抗精神病薬が2種類以下の割合
41


# Page. 42

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/9E2YXQ11ER.jpg)

入院と外来の記述
全患者
(N = 979,756)
・精神科出来高病棟以外の入院
(n = 211,037)
精神科出来高病棟
(n = 13,472)
外来
(n = 755,247)
・統合失調症なし(n = 748,165)
・通院精神療法のない統合失調症
(n = 828)
・統合失調症なし (n = 5,650)
統合失調症 (主傷病)
(n = 7,822)
通院精神療法 +
統合失調症 (主傷病)
(n = 6,254)
・抗精神病薬なし (n = 431)
・抗精神病薬なし (n = 544)
抗精神病薬あり
(n = 7,391)
抗精神病薬あり
(n = 5,710)
42


# Page. 43

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/D7YG8WZ47M.jpg)

抗精神病薬が3種類以上の割合
43


# Page. 44

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/VENGQ936J8.jpg)

論文受理
44


# Page. 45

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/Y79WD29R73.jpg)

研究成果の影響
朝日新聞 (2013/8/20朝刊)
臨床精神薬理誌 優秀論文賞
平成26年度診療報酬改定
45


# Page. 46

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/G78N359GJD.jpg)

研究遂行の課題
◼データハンドリング開発の無駄
◼全データの記述からリサーチ・クエ
スチョンを精査する無駄
46


# Page. 47

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/L7LPVYWXJR.jpg)

NDBサンプリングデータセット
の利用経験: 普及に向けた試み
47


# Page. 48

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/4EM4GN93JW.jpg)

ハードル激減への試み
◼標準データセットの作成
◼網羅的解析による基礎資料の公表
48


# Page. 49

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/PERWZDGRJ9.jpg)

昨年度の発表
SQLiteを使ったNDB サンプリングデータ
セット標準データセット作成の試み
奥村泰之
一般社団法人臨床疫学研究推進機構 代表理事
第6回NDBユーザー会 2023/9/15 (金) 15:20~16:00
日本科学未来館 未来館ホール
自由集会 NDB 分析して困ったこと、できたこと等
SQLiteを使ったNDB サンプリングデータセット標準データセット作成の試み
(https://www.docswell.com/s/icer/KYWGNV-2023-10-07-095629)
49


# Page. 50

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/P7XP91XYJX.jpg)

SQLプログラム使用のイメージ
元データ
命令
データベース
整然化
50


# Page. 51

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/37KDP2W4ED.jpg)

前提条件
① 各自が，NDB利用申出をする
② 各自が，スタンドアローンの環境で，端
末とストレージを整備する
③ 各自が，SQLiteとRをインストールする
④ Rプログラムが共有される
⑤ 各自が，Rプログラムを実行する
51


# Page. 52

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/LJ3RX41DE5.jpg)

開発環境
あえて貧弱な環境を設定
ワークステーション
Dell Mobile Precision Workstation 3551
CPU
6コア/2.7GHz
メモリ
64GB (32GBでも稼働)
ストレージケース
STARDOM SR2-B31
ストレージ
Micron MTFDDAK1T9TDS-1AW1ZABYY
1.92TB SSD 5300×2
52


# Page. 53

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/8JDY2QX2JG.jpg)

SQLiteはファイルを設置するだけ
SQLite: https://sqlite.org/index.html
53


# Page. 54

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/VEP61LPL78.jpg)

２つのＲプログラムで整然化
複数月のファイルを1
つのテーブルに格納
複数のテーブルを整
理・統合
54


# Page. 55

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/27V3YQ26JQ.jpg)

元のcsvファイル，2178ファイル181GB
2012年1月~2020年1月診療分
5.72GB/66ファイル/診療月
55


# Page. 56

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/5JG39WR2EL.jpg)

整然化済みのDB，サイズは565GB
56


# Page. 57

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/47Q5W3V9EP.jpg)

テーブル構成と情報源
名称
説明
情報源
統合REテーブル 患者背景テーブル RE，HO，BU
統合IYテーブル
医薬品テーブル
IY，CZ，SH，CD
CDとIYの重複分は除外
統合SIテーブル
診療行為テーブル SI，CD，SK
CDとSIの重複分は除外
統合SYテーブル 傷病名テーブル
SY，SB
57


# Page. 58

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/KE49K1WRJ1.jpg)

標準データセット作成のSQLプログラム
を活用した論文例
Ishizuka K: Asian J Psychiatr. 2024 Feb 7:94:103961. doi: 10.1016/j.ajp.2024.103961.
Ishizuka K: Psychiatry and Clinical Neurosciences Reports. doi: 10.1002/pcn5.147
58


# Page. 59

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/L71KXGYVEG.jpg)

ユーザーの声①
◼手始めに3回分のサンプリングデータ
セットを申請し，ターミナルでコマ
ンドを打ってなんとかしようとして
いました。が，なんともなりません
でした。
◼こんなに簡潔に処理できると知って
いれば全期間のデータセットを申請
したかったです。
59


# Page. 60

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/G7WDNKG3E2.jpg)

ユーザーの声②
◼分割された状態で提供されるNDBサ
ンプリングデータセットを統合RE
テーブル、統合SIテーブル、統合SY
テーブル、統合IYテーブルに成型する
プログラムは本当に助かりました
◼講義、研究指導、研究科運営の合間
を縫って進めることを考えると、数
カ月～1年の時間の節約になったと感
じています。
60


# Page. 61

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/4JZG3ZLG73.jpg)

網羅的解析による基礎資料の公開
臨床疫学研究推進機構: https://icer.tokyo/materials /ndb_feasibility_check/
61


# Page. 62

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/YE6YXZWQJV.jpg)

薬剤，診療行為，傷病名の網羅的解析
62


# Page. 63

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/GE5GXWM2E4.jpg)

薬剤クラスごとの分析
◼ 外来/入院の処方
◼ 年齢区分別・外来/入院の処方
◼ 外来/入院の上位 30 傷病
◼ 年齢区分別・外来/入院の上位 15 傷病
◼ 主たる適応症の診療期間別・外来の処方
63


# Page. 64

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/972YXQ917R.jpg)

外来における抗不安・睡眠薬トップ10の
推移
64


# Page. 65

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/DJYG8W44JM.jpg)

診療行為ごとの分析
◼ 外来/入院の上位 200 傷病名
◼ 区分番号別の外来/入院患者数
◼ 年齢・区分番号別の外来/入院患者数
◼ 区分番号別・外来/入院の上位 50 傷病名
◼ 年齢・区分番号別・外来/入院の上位 30
傷病名
65


# Page. 66

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/V7NGQ9Y6E8.jpg)

精神科専門療法，外来患者数の推移
66


# Page. 67

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/YJ9WD2PRJ3.jpg)

網羅的解析を活用した論文例
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# Page. 68

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/GJ8N35DGED.jpg)

サンプリングデータセットの事務的課題
◼利用申出における研究目的等の記述の必
要性は疑問
◼匿名化ルールは，少し緩めて欲しい
◼支払い方法は銀行振込に変えて欲しい
◼データ提供までの期間が無駄に長い
◼公表物確認の必要性は疑問
68


# Page. 69

![Page Image](https://bcdn.docswell.com/page/LJLPVYMXER.jpg)

Take-home Messages
◼NDBサンプリングデータセット利活
用に向けたハードルを激減できた
◼特別抽出で頓死する前に，気軽に
チャレンジして欲しい
◼零細企業が赤字垂れ流しで持続する
のは厳しいので支援があると嬉しい
69


